رئیس آزمایشگاه: دکتر سیاوش دستمالچی
شماره تماس: 04133364038
dastmalchi.s@tbzmed.ac.ir
مطالعات تحقیقاتی در آزمایشگاه ساختاری Bioinformatics و Molecular Design (SBMD) در مدل سازی مولکولی و طراحی داروهای محاسباتی متمرکز شده است. زمینه های منافع تحقیقاتی آزمایشگاه شامل ساختارهای پیش بینی کننده ماکرومولکول ها ، تدوین روش هایی برای پیش بینی ساختار پروتئین های غشایی ، بررسی برهم کنش های گیرنده دارو و روابط کمی بین فعالیت و ساختار (QSAR) است.
آزمایشگاه SBMD مجهز به آرایه رایانه های شخصی و خوشه ای مبتنی بر لینوکس است که دارای نرم افزارهای مختلف مدل سازی مولکولی است.
خوشه مبتنی بر لینوکس بیوانفورماتیک آزمایشگاه SBMD دارای 32 پردازنده (Opteron 2.0 گیگاهرتز) است. 8 گره با دو پردازنده Opteron 2212 دو هسته ای ، رم 2 گیگابایتی و هارد دیسک 80 گیگابایتی وجود دارد. این تسهیلات برای کارهای سنگین خرد تعداد مانند شبیه سازی های دینامیک مولکولی طولانی ساختارهای ماکرومولکول و محاسبات سنگین مورد استفاده قرار می گیرد. برنامه هایی مانند Gromacs ، NAMD و Dock در میان دیگران مورد استفاده قرار می گیرند.